Upravni odbor Univerziteta “Džemal Bijedić” u Mostaru predstavlja organ upravljanja odgovoran za poslovanje Univerziteta, a sačinjava ga ukupno devet članova.
Od pomenutog broja, tri člana imenuje osnivač, odnosno Vlada Hercegovačko-neretvanskog kantona, od kojih je jedan zamjenik predsjednika Upravnog odbora Univerziteta. Preostalih šest članova imenuje Senat iz reda stalno zaposlenog osoblja Univerziteta. Članovi Upravnog odbora se biraju na četiri godine, a u mandatnom periodu 2020 – 2024 upravljanje Univerzitetom povjereno je:
Dr. sc. Adis Zilić , Predsjednik - Fakultet humanističkih nauka
Dr. sc. Semina Hadžiabulić - Agromediteranski fakultet
Dr. sc. Irma Dedić - Ekonomski fakultet
Dr. sc. Edin Rizvanović - Pravni fakultet
Dr. sc. Maja Popovac - Građevinski fakultet
Dr. sc. Damir Đedović - Nastavnički fakultet
Predstavnici osnivača:
Prim. dr. Adnan Velagić
Dipl. ing. el. Ragib Šuta
Aid Tulek